Perlit je možné použiť ako prímes do substrátov na pestovanie izbových a balkónových rastlín. Má vynikajúce vlastnosti na zadržiavanie a uvoľňovanie vody. Vďaka tomu majú rastliny zasadené do pôdy s prímesou perlitu ľahší prístup najmä v suchých obdobiach. Takýto substrát schne pomalšie. Odporúča sa, aby tento substrát obsahoval 10 - 30% perlitu, ktorý je potrebné zmiešať so substrátom pri jeho príprave. Napríklad na 3 litre zeminy v črepníkoch by ste mali pridať až 1 liter perlitu. Perlit možno použiť aj ako drenážnu vrstvu pri pestovaní rastlín v črepníkoch. Výborne sa hodí aj na zakoreňovanie odrezkov a ako substrát pri profesionálnom pestovaní.